La mayoría de los antibióticos se basan en productos naturales sintetizados por bacterias y hongos. Quinolonas (como Cipro) y sulfamidas (como sulfametoxazol) son las principales excepciones a esta regla.
Los antibióticos pertenecen a una clase de compuestos naturales llamados metabolitos secundarios. Estas son moléculas que no son esenciales para el crecimiento y metabolismo normal (como azúcares, aminoácidos y ácidos nucleicos) pero desempeñan funciones especializadas. Los metabolitos secundarios permiten a las criaturas que no pueden moverse o hablar comunicarse, controlar sus entornos y defenderse.
Las bacterias, las plantas y los hongos son mucho mejores que los químicos humanos para crear moléculas complejas. Estas biosíntesis a menudo se llevan a cabo en fábricas dentro de las células, grandes complejos de enzimas en los que se ensamblan, modifican y transmiten varios precursores e intermedios.
La vancomicina, el antibiótico más comúnmente recetado en los hospitales de EE. UU., Es un buen ejemplo:
De Bis-cloración de un hexapéptido-PCP conjugado por la halogenasa implicada en la biosíntesis de vancomicina
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Aunque la síntesis total de vancomicina se ha logrado en los laboratorios, creo que todavía se produce comercialmente mediante la fermentación de la bacteria Amycolatopsis orientalis a partir de la cual se aisló por primera vez.
Lo que hay que tener en cuenta acerca de estos metabolitos secundarios es que cualquier cosa que sea producida por una enzima también puede descomponerse mediante una enzima, a menudo la misma que la formó. Pequeños ajustes a estas enzimas, o simplemente ponerlas en un ambiente diferente, pueden hacer que degraden los antibióticos. La resistencia a los antibióticos es, por lo tanto, una característica intrínseca e inevitable del uso de antibióticos.