Tamaño del genoma humano = 3 × 10 ^ 9 pb
Reconocimiento de EcoRI seq = GAATTC (6bp, palindrome)
Frecuencia de ocurrencia del sitio de reconocimiento de EcoRI en una secuencia dada considerando que las 4 bases tienen la misma probabilidad de ocurrencia:
(1/4) ^ 6 = 1/4096
es decir, un sitio EcoRI se puede encontrar en 4096 pb.
Ahora el número de sitios en el genoma humano = 3 × 10 ^ 9/4096
= 732421.875
Como EcoRI no puede cortar una secuencia si no está completa, se pueden encontrar 732421 sitios de reconocimiento en el genoma humano.
Como sabes, el genoma humano es genoma lineal, y cuando lo digieres con Endonucleasa de Restricción que tiene un sitio de reconocimiento, siempre da dos fragmentos.
significa que si hay n sitios, habrá n + 1 fragmentos .
Entonces, el número total de fragmentos de genoma humano generados por digestión con EcoRI (completo) = 732421 + 1 = 732422
HindII sitio de reconocimiento = GTYRAC (6bp)
donde Y = cualquier pirimidina (C o T)
R = cualquier purina (A o G)
Frecuencia de ocurrencia = 1/4 x 1/4 x 1/2 x 1/2 x 1/4 x 1/4
= 1/1024
Número de sitios de reconocimiento HindII en el genoma humano = 3x 10 ^ 9/1024
= 2929687.5 = 2929687
número total de fragmentos de genoma humano generados por digestión HindII (completo) = 2929687 + 1 = 2929688
Ref: EcoRI | NEBRASKA
Enzima de restricción tipo 2 HindII
HindII – Wikipedia
Finalización del Proyecto del Genoma Humano: Preguntas Frecuentes
¡Atentamente!
