El complejo de poro nuclear debe ser capaz de acomodar moléculas de carga de muchas formas y tamaños diferentes, a la vez que es selectivo y solo permite la carga específica (determinada por la importación o la asociación). Una estrategia para permitir esto es la formación de una barrera de permeabilidad flexible que normalmente bloquea el poro, pero que se puede mover a un lado cuando la carga objetivo necesita pasar.
Esto, en parte, se piensa que se lleva a cabo mediante nucleoporinas que contienen repeticiones de FG o FG-Nups. FG se refiere a una secuencia repetitiva de aminoácidos (fenilalanina y glicina) que están presentes en estas proteínas. Los tramos largos de estas repeticiones tienden a ser flexibles y desestructurados, lo que significa esencialmente que ocupan una gran cantidad de espacio a lo largo del tiempo. Los FG-Nups están presentes en el interior del poro en la mayoría de las especies, con las repeticiones de FG frente al poro, lo que significa que las partes hidrofóbicas de estas proteínas están llenas de espacio y están perfectamente posicionadas para bloquear los poros y formar una barrera de permeabilidad.
