¿Cuáles son algunas estructuras secundarias interesantes en el ARN?

ARN de la telomerasa:

1. El componente de ARN de la telomerasa actúa como una plantilla para la síntesis de los telómeros y se une a la transcriptasa inversa y proporciona un andamio para la unión de las proteínas RNP.
2. El análisis de la estructura secundaria del ARN de la telomerasa resultó en un descubrimiento sorprendente de pequeños motivos de ARN nucleolar incrustados dentro de la molécula, sugiriendo que la “expansión” evolutiva para los ARN de la telomerasa de mamíferos parece ser el resultado de la fusión con un motivo de ARN preexistente: una caja H / ACA snoRNA [1].
3. Se ha observado en la literatura que los ARN a menudo comparten poca homología de secuencia dentro de las familias, lo que dificulta su identificación mediante búsquedas de homología. Sin embargo, la estructura secundaria del ARN de la telomerasa de vertebrados ha encontrado tener una topología similar a la estructura del ARN de la telomerasa ciliada (el resultado para 1 y 2 se obtuvieron en el mismo año 1999). Esto significa que existe una conservación evolutiva de la arquitectura general del ARN de la telomerasa [2].
4. Pseudoknots: A continuación se muestra la estructura secundaria de Tetrahymena telomerasa ARN pseudoknot obtenido a partir de la solución de estructura de RMN [3]. (Podrías jugar con su estructura si quieres, me gusta así.) Los pseudonudos tienen un significado biológico crítico ya que representan un grupo estructuralmente diverso: tienen diferentes longitudes de bucles y tallos, por lo tanto, los tipos de interacciones entre ellos.
   Papeles biológicos: Incluyen la formación del núcleo catalítico de varias ribozimas, [4] intrones autocorte [5] y telomerasa. [6] Además, estos pseudoknots también desempeñan papeles críticos en la alteración de la expresión génica al inducir el desplazamiento del marco ribosómico en muchos virus [ 7].

[Fuente: http://www.rcsb.org]

Si está interesado, aquí algunos documentos de investigación que hablan más sobre esto en profundidad:

• Arquitectura del ARN de la telomerasa humana
• Análisis de la estructura del ARN de la telomerasa humana in vivo
• Análisis funcional de la estructura de pseudoknot en ARN de telomerasa humana.

Notas a pie de página

[1] http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/…

[2] http://www.sciencedirect.com/sci…

[3] La estructura de Tetrahymena telomerase revela subunidades, funciones e interacciones previamente desconocidas.

[4] Se requiere un pseudo nudo de largo alcance para la actividad de la ribozima Neurospora VS.

[5] Estructura cristalina de un intrón del grupo I que se empalma a sí mismo con ambos exones.

[6] La estructura del pseudoknot del ARN de la telomerasa humana revela interacciones terciarias conservadas esenciales para la función.

[7] Pseudoknots: Estructuras de ARN con diversas funciones