Las purezas del proceso sintético pueden causar algunos problemas. La síntesis de péptidos no es 100% perfecta y pueden producirse deleciones y racemizaciones de aminoácidos. Típicamente, los péptidos sintéticos se venden con una pureza del 95%. En la mayoría de los casos, el 5% restante puede ignorarse. En algunos casos desafortunados, el 5% es un potente inhibidor. Esto no es infrecuente en estudios de péptidos autoensamblantes en los que las impurezas de desamidación [1], la racemización L a D, [2] y los mutantes por deleción, [3] son errores sintéticos comunes, [4] [5] pueden afectar la asociación cinética a niveles muy bajos ya que la auto-oligomerización del péptido es un efecto cooperativo. Esto puede traducirse en diferencias relativamente grandes en muestras aparentemente puras.
Los estudios de las proteínas amiloides son particularmente sensibles a este efecto ya que la formación de amiloide depende de la autoasociación cooperativa de un gran número de péptidos. Un solo péptido defectuoso puede interferir con este proceso. Por ejemplo, la toxicidad de los recombinantes (azul) y sintéticos (rojo) [matemáticos] A \ beta_ {1-42} [/ math] es sustancialmente diferente, que se remonta a un cambio en la autoasociación que es detectable cuando una pequeña cantidad de péptido sintético se agrega a la muestra (verde, segundo gráfico). [6]
Las impurezas peptídicas que son antígenos fuertes pueden dar fuertes falsos positivos incluso cuando están presentes en pequeñas cantidades [7] [8] [9] [10], lo que puede causar problemas importantes durante el desarrollo o la fabricación de la vacuna.
Notas a pie de página
[1] Los bajos niveles de desamidación de asparagina pueden tener un efecto dramático en la agregación de péptidos amiloidogénicos: implicaciones para el estudio del amiloide para … – PubMed – NCBI
¿Es posible predecir el cambio en la conformación de una proteína después de unirse a un ligando?
¿Existen hélices alfa diestras en el agua?
¿Qué estudio es más esencial para comprender la biofísica, la biología molecular o la bioquímica?
[2] El péptido amiloide-β recombinante Aβ1-42 se agrega más rápido y es más neurotóxico que el Aβ1-42 sintético
[3] Identificación del contaminante peptídico primario que inhibe la fibrilación y la toxicidad en amiloide β42 sintético
[4] Impurezas relacionadas en medicamentos peptídicos
[5] Evaluación de la calidad de péptidos sintéticos de detección de quórum utilizados en I + D
[6] Identificación del contaminante peptídico primario que inhibe la fibrilación y la toxicidad en amiloide β42 sintético
[7] Impurezas peptídicas en péptidos sintéticos comerciales y sus implicaciones para la evaluación de ensayos de vacunas.
[8] Influencia de los perfiles de impurezas peptídicas en la respuesta funcional del baño órgano-órgano: El péptido 11-meros INSL6 [151-161] caso
[9] El impacto de las impurezas en péptidos sintéticos sobre el resultado de los ensayos de estimulación de células T
[10] Péptidos poco solubles pueden imitar respuestas ELISPOT auténticas.
