¿Cuál es el software que los laboratorios farmacéuticos usan más (SAS o R)?

Tenemos que diferenciar los laboratorios de los CRO.

En los laboratorios, tanto SAS como R se usan durante años para el desarrollo de fármacos. La última vez que pasé mucho tiempo siendo entrevistado por algunos laboratorios farmacéuticos (en su mayoría indios) y R fue requerido con bastante frecuencia. R es una de las industrias estándar en la medicina basada en la evidencia durante años y actualmente es el único competidor de SAS en cuanto al alcance de los métodos estadísticos cubiertos. Mire mi presentación (un poco desactualizada, pero aún válida) en: R en Investigación Clínica y Medicina Basada en la Evidencia (o PDF en CRAN). Sin embargo, SAS es el líder indiscutible en esta industria y esto no va a cambiar en las próximas décadas. Recientemente observé que SAS se combina con R [1].

Con respecto a los CRO , depende del tipo de prueba y dónde se envían los resultados:

  • en ensayos observacionales, se utilizan tanto SAS como R, pero, una vez más, SAS lidera
  • en las primeras fases (0-IIb) y post-mercado (IV) ambos se utilizan, pero, una vez más SAS es líder. R compite aquí con WinNonlin para análisis de PK / PD / DR.
  • en la fase III,
    • presentación enviada a la FDA: SAS se usa en un 99%, pero se reciben sumisiones R. La FDA no requiere SAS, solo la salida debe proporcionarse en SAS Transport Format – XPT (que está a punto de cambiar, ya que el nuevo formato XML reemplazará a XPT) y el software debe ser validado (por el proveedor o por CRO; , versiones comerciales de R también están disponibles)
    • presentación a otras agencias, como EMA: se utilizan ambos programas, R es popular allí

PD: por si acaso, olvídate de Python con respecto a la bioestadística clínica. No se usa en la investigación clínica ni es de confianza (no hay tradición detrás), también Python todavía no cuenta con muchos métodos estadísticos importantes que se usan allí. Python es, sin embargo, utilizado en el desarrollo de moléculas de drogas.

Notas a pie de página

[1] http://www.kcrcro.com/uploads/at…

R se está volviendo cada vez más popular, pero SAS sigue en la posición de liderazgo. Parte de la razón es la calidad del software y el soporte, pero también hay un componente histórico.

En los EE. UU., La agencia que aprueba nuevos medicamentos y dispositivos médicos (FDA o Administración de Alimentos y Medicamentos) tuvo que definir formatos aceptables para presentar los datos para corroborar los resultados de los ensayos clínicos. Por ley, no podrían exigir a los patrocinadores de medicamentos que utilicen un formato de proveedor de marca particular. La mayoría de la programación estadística farmacéutica se estaba haciendo en SAS. SAS publicó su versión 5 del formato de archivo de transporte y lo puso en el dominio público para que ya no fuera propietario y cualquiera pudiera poner sus datos de ensayos clínicos en este formato e incluirlos en una NDA (Nueva Aplicación de Drogas) con o sin licencia de Software SAS. . SAS ahora está en la versión 9.4, pero aún proporciona formatos de archivos de exportación simples y con retrocompatibilidad a los archivos de transporte de la versión 5. Las limitaciones de este antiguo formato de archivo incluso han influido en estándares de presentación más modernos como CDISC, razón por la cual los nombres de las variables CDISC están restringidos a solo 8 caracteres, porque SAS tenía la misma limitación (el SAS actual permite nombres de variables de hasta 32 caracteres). Esta historia le da a SAS otra ventaja en su continuo dominio del software de programación farmacéutica.

Los grupos de Wetlab usan JMP. También lo hace la FDA. Sin embargo, los grupos clínicos generalmente usan SPSS.

SAS. período.

La mayoría de las organizaciones de investigación clínica (CRO) utilizan SAS. Aunque R y Python se están uniendo y se prevé que tomará una importante cuota de mercado de SAS.