¿Cómo puede uno deshacerse de las sales / iones de la solución salina tamponada con fosfato (PBS) de la solución donde la proteína es el analito para obtener un espectro de masa “limpio”?

Otros dos han proporcionado “cómo” y están de acuerdo: diálisis.

En lugar de “cómo”, me gustaría saber “¿por qué?”

Los iones en PBS no deberían interferir con la espectrometría de masa de una macromolécula.

Uno puede usar:

una membrana osmótica
extracción en fase sólida del tipo apropiado (fase inversa principalmente)
filtración en gel en algo como Sephadex