Trazo evolutivo (ET) (Lichtarge 1996, un método de trazado evolutivo que define las superficies de unión comunes a las familias de proteínas, Mihalek 2004).
Hace esencialmente lo que dijo el respondedor anterior (escaneo mutacional basado en laboratorio = hacer un montón de alineamiento de secuencias y buscar variabilidad) pero a una escala mayor. Pero ET examina secuencias y estructuras de proteínas homólogas en diferentes especies, que están cada vez más disponibles en bases de datos, con el fin de utilizar la gran cantidad de mutaciones y ensayos que ya se probaron a través de la evolución. Asigna un rango basado en la “conservación evolutiva”, que es el inverso de su variabilidad.
Esencialmente, ET busca clasificar la importancia funcional relativa de los aminoácidos de una secuencia proteica al correlacionar sus variaciones sobre la evolución con las divergencias en el árbol filogenético de esa familia de secuencias, que se agrupan espacialmente en la estructura de la proteína (Madabushi 2002) y revelar así el ubicación de los sitios funcionales (Yao 2003).
Servidor de seguimiento evolutivo
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