Se trata de si los electrones del par solitario del nitrógeno contribuyen a la aromaticidad o resonancia, lo que lo hace menos nucleófilo y, por lo tanto, menos reactivo a la alquilación.
El par solitario en N7 de Guanine está en un orbital hibridado sp3 y no contribuye sus electrones a la aromaticidad en Guanine. Por otro lado, N1 en guanina tiene un par solitario que está en un orbital p y contribuye a la aromaticidad de Guanine.
Debido a que el par solitario en N1 es parte de la aromaticidad, reduce su reactividad y, por lo tanto, su capacidad de alquilación. El grupo amino primario unido al carbono 2 en la estructura cíclica de 6 anillos de la guanina puede participar en la resonancia y es menos reactivo como resultado.
El par solitario de N7 solo no es parte de la resonancia o la aromaticidad y es el más propenso a la alquilación por un agente alquilante como el yoduro de metilo (en un rxn de SN2), por ejemplo.
