Dos importantes obstáculos para un trasplante alogénico de médula ósea exitoso para algunas leucemias son la infección y la enfermedad del huésped del injerto contra huésped. En GVHD, el injerto lleva al cuerpo a ser extraño y monta una respuesta asesina. La GVHD puede prevenirse mediante el uso de fármacos inmunosupresores o la depleción de células T.
También se realiza un trasplante de célula agotada (para prevenir la EICH) seguido de una infusión de leucocitos de donante (para evitar recaídas).
