Se conocen pseudoespecies víricas del VIH que son resistentes a la mayoría de los ARV y, en cierta medida, competentes para la replicación en presencia del resto. Sin embargo, como una cuestión funcional, estos clados no son tan competentes para la replicación como las pseudoespecies que son más susceptibles a los fármacos. No comprendemos completamente todos los factores que determinan qué pseudoespecies están presentes en un paciente individual. Sin embargo, la competencia relativa de replicación de las cepas MDR es al menos una de las razones por las que los pacientes pueden mantener cargas virales indetectables a pesar de que todavía tienen una enfermedad de mutación rápida.
Existe un subconjunto muy pequeño de pacientes que presentan virus resistentes a múltiples fármacos en el primer diagnóstico, y ese es definitivamente un lugar de mayor riesgo. Pero incluso aquellos que típicamente se pueden manejar con * alguna * combinación de ARV. Puede tomar un régimen de cuatro medicamentos que incluya un inhibidor de la integrasa y / o un inhibidor de la proteasa sobre la combinación anterior de 2 NRTI + un NNRTI.
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