En ensayos clínicos, el modafinil y el armodafinil se asociaron con una baja tasa de elevaciones de la aminotransferasa sérica y la fosfatasa alcalina (<1%).
Además, a pesar del uso a gran escala, no ha habido informes de daño hepático clínicamente aparente debido a modafinil o armodafinil.
Se han informado casos raros de reacciones de hipersensibilidad e incluso síndrome de Stevens Johnson después del uso de modafinilo y estas reacciones pueden ir acompañadas de evidencia de afectación o lesión hepática.
