Todavía se está investigando, por lo que esta respuesta se debe actualizar de vez en cuando [si recuerdo].
La evidencia más reciente es un estudio de laboratorio que infecta diferentes tejidos humanos con el virus Zika, y señala que el virus mató a las células madre neurales … las células exactas que se convertirían en tejido cerebral en un feto.
http://www.cell.com/cell-stem-ce…
Por cierto, agregaría que existen cero pruebas o mecanismos para cualquier otra cosa [vacunas, larvicidas, extraterrestres, etc.] que causan microcefalia. Todos los días, la evidencia del virus que causa la microcefalia crece, mientras que la evidencia de que el virus no está involucrado o requiere un co-factor permanece en cero.