La decisión no se basa en cómo se ve la infección. Los cultivos de sangre y (si es posible) los cultivos de heridas dirían qué tipo de antibiótico se necesita para matar a esa bacteria específica. Aquí hay una captura de pantalla de una guía básica para la administración de antibióticos. Por supuesto, la decisión es más compleja y toma en consideración si el paciente tiene alergia a algún antibiótico, si la función renal es normal (no se quiere que el paciente sufra insuficiencia renal con un antibiótico, por lo que los análisis de sangre serían repetido y la dosis del antibiótico se ajustará en consecuencia) etc. Una muy buena fuente de información es Sanford Guide to Antimicrobial Therapy (libro y aplicación).
Editar (usado como respuesta a un comentario, es pertinente al tema):
Es común en la atención urgente o ER tratar de forma empírica. El médico tiene experiencia, probablemente hizo una evaluación mental rápida (paciente joven, sano, no diabético = los riñones están bien, la infección de la piel parece celulitis, la herida está abierta al aire = bacterias aeróbicas, etc.) y decidió los antibióticos adecuados. La decisión se vuelve más compleja cuando la infección es recurrente, los síntomas empeoran, el paciente entra en sepsis.