¿Hay otras enfermedades transmitidas por los alimentos como la EEB que no se puede matar al cocinar?

Depende de cómo definas la cocina. Existen algunas bacterias como el botulismo y la giardia que tienen una forma de espora que puede sobrevivir en agua hirviendo. Son matados por temperaturas más altas, 250F en el caso del botulismo.

Esto significa que puedes cocinar algo a una temperatura que matará a las bacterias del botulismo activo, y luego si lo almacenas en condiciones anaerobias donde las esporas pueden eclosionar nuevamente, la comida puede reinfectarse.