Realmente depende de los grupos funcionales que están presentes en la molécula del fármaco. La reacción química más obvia sería una reacción de oxidación en la que un grupo funcional lábil (amino, tio, hidroxilo) es oxidado por el oxígeno.
La otra posible reacción química sería la reacción entre dos moléculas de fármaco que crearía un dímero. Este tipo de reacciones podrían ser esterificaciones, formación de iminas, formación de amidas, etc.
También puede tener reacciones entre la molécula del fármaco activo y los excipientes que se usan para formular el medicamento, aunque esto es más raro ya que los excipientes se eligen típicamente para que no reaccionen con la molécula del fármaco.
