No conozco ninguna infección bacteriana que pueda afectar tanto a los humanos como a los reptiles de esa manera, pero es la primera vez para todo.
Llevar la tortuga a un veterinario: los ojos hinchados pueden ser causados por una infección ocular o una infección respiratoria (que son propensas a las tortugas), por lo que es necesario que lo revisen de inmediato.
Llévate al médico.