Las enzimas son largas cepas de aminoácidos relativamente pequeños. Estos aminoácidos tienen una estructura de base en común, lo que permite los enlaces peptídicos y la creación de una cadena larga. Cada aminoácido también tiene algún grupo funcional que es específico para cada aminoácido.
Algunos grupos funcionales tienen carga negativa o positiva, algunos son anillos de carbono no polares grandes, algunos son capaces de formar puentes de sulfuro covalentes fuertes y algunos son muy pequeños, como el hidrógeno o el metilo.
Hay 20 aminoácidos comunes que forman estos filamentos largos de cientos de aminoácidos (puede tener múltiples del mismo aminoácido en un filamento). Entonces este hilo se pliega en sí mismo de acuerdo con los grupos funcionales que tiene, el plegado es un proceso difícil que aún no se entiende por completo.
La proteína ahora doblada, a menudo con forma esférica, podría tener un centro activo que la convierte en una enzima. El centro activo no es más que un área determinada donde las moléculas se pueden unir debido a las atracciones no polares y polares (cargas positivas o negativas). También hay cambios de enlaces covalentes que se unen más a un sustrato.
Ahora primero debemos ver una reacción. Tomemos el bastón en la imagen como ejemplo, va de A (bastón lleno) -> I (intermediario, bastón doblado) -> B + C (fragmentos de bastón). Y el diagrama de energía correspondiente se muestra junto a él. En el diagrama de energía vemos que A es energía media, I es de alta energía y B + C es la energía más baja (mira la línea punteada).
¿Qué nucleótido de pirimidina se sintetiza primero?
¿Qué membrana cubre la vacuola?
Aquí es donde la enzima entra en juego. El centro activo tiene la forma de la fase intermedia (barra doblada), lo que reduce la energía necesaria para pasar de A -> B + C y hace que la reacción sea mucho más rápida; Recuerdo 10 ^ 8 veces más rápido, pero podría ser incluso más rápido. La enzima no se modifica en absoluto durante la reacción, solo se ocupa el centrum activo de la enzima y vuelve a abrirse cuando se libera el sustrato. Es importante que una enzima no se una al sustrato o producto, ya que no se liberará (fácilmente) más, una enzima se une solo al estado de transición. No hay ninguna razón por la que la enzima se use en una reacción.
Además, una enzima hace que la reacción sea más rápida en A-> B + C y B + C-> A y, por lo tanto, no afecta el equilibrio.
En resumen, la enzima está conformada de tal manera que la transición de A a B se estabiliza, haciendo que pasar de A a B o viceversa sea mucho más fácil y rápido.