Basado en lo que he entendido por su pregunta, supongo que quiere mutar su proteína de interés y realizar análisis … ¿verdad?
Si es así, sugiero seguir los siguientes pasos:
1) Descargue la estructura cristalina de su proteína de interés de PDB.
2) Utilice el software Biovia Discovery Studio (BIOVIA Discovery Studio | Visualization), abra su estructura 3D en él y una vez que lo abra, encontrará una variedad de herramientas para mutar una proteína. Además, puede verificar si la proteína mutada cae en el diagrama de Ramachandran con el software. Otras herramientas incluyen editar sitios de enlace, sitios estructurales, etc. (Necesita explorar … 🙂
3) Alternativamente, vaya a un servidor en línea llamado MutaBind. Este es un servidor en línea para realizar mutaciones e incluso proporciona la estructura cristalina de la proteína mutada junto con su valor Delta G. Podemos evaluar las interacciones proteína-proteína y mucho más. (Los valores de Delta G son de proteína mutada y ayudarán a determinar si la mutación es favorable o no).
Espero que esto ayude 🙂
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