Es probable que su gen sea un factor de transcripción para otra proteína que está directamente implicada en la adhesión celular o que actúa como un control regulador a lo largo de la vía de adhesión celular. Vea ¿Cómo puede una proteína localizada en el núcleo alterar la integridad de la membrana externa?
Puede identificar positivamente un factor de transcripción in vitro mediante un ensayo de cambio de movilidad electroforética (EMSA). El ensayo EMSA busca el cambio hacia especies de mayor peso molecular en un gel de agarosa que se produce cuando un factor de transcripción se une a su objetivo de ADN.
Sin embargo, el ensayo EMSA requiere que haya reducido los posibles objetivos de ADN para su factor de transcripción a un número muy pequeño. Necesita dos carriles en el gel para probar cada objetivo, un carril con el factor de transcripción potencial y otro sin él. Solo puedes analizar 5 genes a la vez en un gel de agarosa estándar, lo que significa que debes tener una buena idea de cuál es el gen objetivo antes de comenzar.
Si EMSA tiene demasiados genes de adhesión celular, deberá confiar en una técnica de mayor rendimiento, como la secuenciación de ChIP, que depende de la secuenciación de fragmentos de ADN genómico después de la coinmunoprecipitación con el factor de transcripción. [1]
Notas a pie de página
¿Puede la misma función biológica ser codificada por diferentes estructuras de proteínas?
¿Por qué es importante la predicción de la estructura de las proteínas?
[1] Estrategias experimentales para estudiar las especificidades de unión del factor de transcripción-ADN
