Típicamente, será difícil expresar la longitud completa de una proteína recombinante que tiene péptidos señal (SP) o dominios transmembrana (TD).
In vivo, el SP se escindirá durante el proceso de proteína madura. La proteína con SP es inmadura y siempre lleva a la proteína a inactiva. Por lo tanto, los SP deben eliminarse antes de la expresión de la proteína. El dominio transmembrana (TD) es muy hidrófobo y generalmente no tiene función biológica. La TD hidrofóbica generalmente no conduce a la expresión de proteínas, ya que es fácil de unir a los elementos clave del metabolismo (como SRP) en E. coli . Además, la TD hidrófoba conducirá a la proteína a una solubilidad y estabilidad muy pobres. Por lo tanto, se sugiere eliminar el dominio transmembrana para el éxito de la expresión de proteína recombinante.
