En términos de química: a) reconocimiento molecular (capacidad de la enzima para reconocer y unir selectivamente uno o dos (raramente más) ligandos en sitios específicos) yb) catálisis (para acelerar las reacciones entre estos dos ligandos). NÓTESE BIEN. En el caso de las hidrolasas, esterasas, peptidasas, proteasas, nucleasas, celulasas y amilasas, etc. de los ligandos es agua.
En términos de evolución: las dos funciones anteriores, ‘a’ y ‘b’ requieren la presencia de grupos funcionales en las cadenas laterales de aminoácidos para orientarse exactamente de la manera correcta. La elección de estos grupos funcionales (es decir, qué aminoácidos deben estar presentes) es una cuestión de selección natural, como lo es la estructura general de la proteína que mantiene la orientación correcta. Sin embargo, estos dos procesos evolutivos son ligeramente diferentes: la selección de los grupos funcionales es crítica, el problema de cómo están orientados puede resolverse de más de una manera. Entonces, la “conservación de secuencia” es más fuerte en el primer caso que en el segundo. Puede verificar esto usted mismo estudiando múltiples alineamientos de secuencia.
