Las células B y las células T que no son de memoria finalmente mueren por apoptosis una vez que se ha eliminado la infección. Una de las principales formas en que esto es mediado es mediante la presencia de un subconjunto especial de células T llamadas células T reguladoras (T regs). Estas reglas detienen la respuesta inmune secretando citocinas inhibidoras tales como IL-10 y TGF-beta. Estas citocinas causan que estas células T y células B experimenten apoptosis. Las células Treg son un tema candente para la investigación ya que también juegan un papel en el cáncer y las enfermedades autoinmunes.
Las células que no se activan son aquellas que no son específicas para el antígeno y simplemente pasan el tiempo como estaban y esperan el antígeno en los ganglios linfáticos en el caso de las células B o circulan en caso de células T vírgenes.
