¿Hay alguna enfermedad contagiosa que, en la fase aguda, sea 100% fatal para las personas?

No. Porque entonces (esencialmente) no habría forma de que la enfermedad se contagie a otras personas. Moriría con sus víctimas. Me doy cuenta de que es posible negar la respuesta a esta pregunta, pero el principio general es que las enfermedades que matan a todos no matan a nadie.