En realidad es un poco complicado. Para 5.38, el 5 sí significa la quinta hélice. Con respecto a los 38, esto se refiere a la posición basada en una convención basada en la alineación de secuencias previamente acordada.
Básicamente, las hélices se alinearon a través de muchas proteínas diferentes, y el residuo más conservado de cada una de ellas. Esto se llamó residuo 50, y el residuo anterior a él 49, el siguiente 51.
Esto funciona principalmente porque los GPCR están muy estructuralmente conservados, por lo que, por ejemplo, 5.50 básicamente siempre estará en la misma posición en todos los GPCR. Por lo que entiendo (no trabajo en GPCR), la numeración difiere ligeramente entre las clases de GPCR, lo que puede hacer que las cosas sean un poco confusas.
