¿Han llegado al mercado alguno de los fármacos diseñados según la estructura de rayos X del receptor adrenérgico Beta-2? ¿Si no, porque no?

Aunque se ha resuelto la estructura del receptor adrenérgico Beta-2 y se han determinado muchas estructuras complejas de receptores adrenérgicos Beta-2 y agonistas del receptor adrenérgico. El desarrollo del medicamento es un trabajo prolongado. Debemos asegurarnos de que…
¿Qué software y métodos usan las personas para crear representaciones de estructuras de proteínas?

Sí, existen estándares para este tipo de visualizaciones y sí, cada uno tiene un significado químico o biológico. Antes de llegar a eso, necesito proporcionar algunos antecedentes básicos sobre la estructura de la proteína y las herramientas de…
Bioinformática: ¿Existe algún software disponible para calcular el índice anfipático definido por Cornette et al. (1987)?

No estoy seguro si ya hay una herramienta disponible para eso. Puedo escribir una secuencia de comandos python para calcular AI.
¿Por qué se han resuelto muy pocas estructuras de GPCR hasta ahora?

1) Son proteínas de membrana. Entre las 35,000 estructuras en bases de datos públicas, menos de 200 son proteínas de membrana [1] 2) Son flojos. Necesita encontrar algo que los estabilice para que puedan cristalizar. Esto es diferente…
¿Cuáles son algunas de las proteínas más complejas estructuralmente?

La palabra complejo aquí puede tener diferentes significados … compleja en función, grande en estructura, elementos estructurales complejos en la proteína (por ejemplo, nudos) o incluso un desorden intrínseco estructuralmente. Para mí, la proteína compleja es la que…
¿Qué temperatura es suficientemente alta para desnaturalizar las láminas beta en las proteínas?

Esta pregunta, tal como está escrita aquí, es demasiado general. La temperatura de fusión varía de proteína a proteína. Sugiero un ensayo de cambio térmico para obtener datos experimentales en su sistema.
¿Qué temperatura es suficientemente alta para desnaturalizar las hélices alfa en las proteínas?

Supongo que depende del porcentaje de alfahelix que compone tu proteína y de la estabilidad de tu proteína. Mi proteína tiene 60% de hélice alfa y una temperatura de 75-80 grados centígrados desnaturaliza la hélice alfa a aproximadamente…
¿Cuál es la diferencia entre determinar la estructura de una proteína a través de RMN y determinarla mediante cristalografía de rayos X?

Cuando usa la RMN, mide el efecto que tiene una proteína en un campo magnético y usa las mediciones (y muchos cálculos) para reconstruir la proteína original. Fuente: www.wenmr.eu Cuando haces cristalografía de rayos X, tienes que forzar…
¿Por qué la mayoría de las hélices alfa en proteínas son diestras?

La primera sección proporciona información de fondo muy básica sobre ángulos diedros y tramas de Ramachandran. Pase a la segunda sección si ya está familiarizado con estos términos y desea obtener la respuesta más directamente. 1. Restricciones en…
¿Por qué la urea es tan buena para desnaturalizar proteínas?

Nadie sabe a ciencia cierta cómo las proteínas desnaturalizan a la urea. Existen varias teorías rivales, pero la evidencia experimental más sólida respalda un modelo en el que la urea forma enlaces de hidrógeno con grupos amida expuestos…