¿Es necesaria la cantidad de aminoácidos en proteínas grandes o podría considerarse que muchos de estos aminoácidos son ácidos nocivos que se pueden perder para mantener su función?

Probablemente rara vez tienen una función cero. Hacer proteínas es costoso y las proteínas extrañas pueden provocar daños, por lo que es probable que la evolución las elimine.

Titus (~ 30,000 aminoácidos) es descomunal porque su función requiere ser descomunal: la proteína actúa como una regla molecular.

La ciclosporina sintetasa es enorme (~ 15,000 aminoácidos) debido a una estructura modular: cada módulo a su vez se compone de múltiples dominios. Esos dominios no son inusualmente grandes por sí solos (la titina también está compuesta de muchos dominios).

Sospecho que las proteínas más grandes son así: grandes ensamblajes de dominios de tamaño ordinario.

Imagine vivir en un piso superior del rascacielos de 100 pisos. Este es tu departamento. Vamos a llamarlo un centro activo. En su analogía, todo lo demás excepto el centro activo funcional (también conocido como 99 pisos debajo de su piso funcional, todos los servicios de plomería, electricidad, ascensores, etc.) se considera “basura”. Ahora, no he visto ningún rascacielos, donde el piso 100 colgara solo en el cielo, sin cimientos ni globos de aire caliente. Por lo tanto, considere el resto de la proteína como un “andamio”, permitiendo que estos 5 aminoácidos funcionales se orienten y realicen adecuadamente el trabajo estereoespecífico selectivo.

Algunos lo son, otros no. La función de la proteína depende de la forma de la proteína, cómo la proteína cambia de forma en diversas condiciones, carga de restos de aminoácidos específicos (por separado y en combinación) y otros factores.

A veces, es posible eliminar o agregar un solo aminoácido en una ubicación particular sin interrumpir la función. A veces, es posible sustituir un aminoácido similar (como leucina e isoleucina) que tiene aproximadamente las mismas propiedades de cadena lateral. Algunas veces, el aminoácido particular en un lugar particular no puede ser sustituido en absoluto (común con prolina, glicina y cisteína) sin interferir seriamente con la estructura de mayor nivel y por lo tanto con la función de la molécula.

Interesante pregunta. Solo quería poner algunos datos que realmente exploraron algo de esto por Lynch y Marinov. La traducción es bastante costosa, especialmente en relación con la transcripción … por lo tanto, aunque el ADN basura persiste definitivamente, los residuos de aminoácidos no deseados serán relativamente menos comunes. Sin embargo, no estoy seguro de cómo responder completamente a tu pregunta.

El costo de un nuevo gen