Probablemente rara vez tienen una función cero. Hacer proteínas es costoso y las proteínas extrañas pueden provocar daños, por lo que es probable que la evolución las elimine.
Titus (~ 30,000 aminoácidos) es descomunal porque su función requiere ser descomunal: la proteína actúa como una regla molecular.
La ciclosporina sintetasa es enorme (~ 15,000 aminoácidos) debido a una estructura modular: cada módulo a su vez se compone de múltiples dominios. Esos dominios no son inusualmente grandes por sí solos (la titina también está compuesta de muchos dominios).
Sospecho que las proteínas más grandes son así: grandes ensamblajes de dominios de tamaño ordinario.