¿Por qué la gente quiere inhibir la actividad de una proteína en lugar de eliminar la proteína?

En primer lugar, noquear un gen (no se eliminan las proteínas porque son los genes que las codifican) es más costoso porque es más difícil de hacer que la inhibición. No solo debe ingresar las celdas de interés, sino que debe apuntar su ADN y realizar manipulaciones complicadas para detener solo el gen que desea detener. La terapia génica todavía está en las etapas iniciales de uso generalizado.

Segundo, casi todas las proteínas tienen funciones legítimas y pueden ser necesarias para etapas críticas de desarrollo y metabólicas. Por lo tanto, noquear una proteína solo por una enfermedad puede tener muchas consecuencias no deseadas.

Aquí es donde interviene la inhibición. Cuando las personas tienen alergias, toman medicamentos antialérgicos y pueden suspenderse cuando no están sufriendo esos síntomas. Los inhibidores generalmente no son permanentes; están diseñados para ser metabolizados o excretados con desechos corporales para que no se acumulen (= posibles efectos secundarios y toxicidad).

Las proteínas son realmente una enorme estructura molecular, que consta de largas cadenas de aminoácidos, cientos por lo general, por lo que desde un punto de vista molecular son gigantes. Mientras tanto, la mayoría de las proteínas que son bioactivas tienen un sitio específico que es el sitio de la actividad de esa proteína, conocido como dominio funcional. Este sitio puede ser muy específico, por ejemplo, la aspirina se une e inhibe el dominio funcional de una enzima conocida como ciclooxigenasa, que es la enzima inicial en la síntesis de muchas biomoléculas, incluidas las relacionadas con el dolor y la coagulación sanguínea. Es mucho más fácil obtener una molécula pequeña para bloquear la parte funcional de esta gran molécula, que tratar de “eliminar” la proteína (y con eso supongo que te refieres a eliminar, degradar o eliminar la proteína completamente de el medio ambiente). Derribar una proteína específica de un sistema biológico es un proceso increíblemente difícil, mientras que encontrar una sustancia que se una a la proteína y evite su funcionamiento es mucho más fácil. Además, volviendo al ejemplo de la aspirina. Solo porque tengo dolor de cabeza y, por alguna razón, mis enzimas ciclooxigenasas están actuando en horas extras y curándome un dolor temporal, no significa que quiera eliminar las enzimas de mi sistema, simplemente ignórelas por un tiempo. Una diferencia principal entre la inhibición y la eliminación completa (“knock out”).

Finalmente, las proteínas son el producto final de la actividad del ADN en todas las células. Existe algún tipo de proceso de retroalimentación por el cual la presencia de la proteína tiende a inhibir el proceso de señalización del ADN para producir más de esa proteína dentro de una célula. Por el contrario, la falta de esa proteína hará que el mecanismo del ADN se acelere nuevamente, y después de eliminar esa proteína, tus células simplemente generarán más.