[Si bien me siento halagado de que la gente solicite mi opinión sobre estos temas, debo decir que la proteómica es compleja en extremo. Así que mientras haré todo lo posible para señalarte en la dirección general correcta. Por favor, comprenda que simplemente no es logísticamente posible responder la mayoría de las preguntas en este campo de estudio de forma exhaustiva en este tipo de foro.]
Dicho eso, lo mejor que puedo decir es que depende principalmente de la configuración de la cromatografía, que está principalmente impulsada por las necesidades del espectrómetro de masas para aislar e identificar la proteína diana.
El análisis de proteínas comúnmente requiere técnicas de “nano LC” o “LC capilar” para aislar e identificar mejor la proteína diana (Google “deconvolución de proteína” si desea que su cabeza explote). Entonces, con esos métodos, estará más preocupado por la tasa de inyección que por el volumen. El volumen solo necesita ser adecuado para mantener la inyección a la velocidad prescrita durante el tiempo que necesite completar la ejecución. Una velocidad de inyección razonable para nanoLC es algo así como 500nL / min. Un tiempo de ejecución razonable podría ser de 30 minutos, por lo que obtendría algo así como 15μL.
Para obtener más información, aquí hay un gran ejemplo de un estudio de proteínas con una descripción completa de la preparación de la muestra, la configuración del instrumento y el procedimiento de análisis (PDF):
Página en phas.ubc.ca
