¿Cuál es la curva de aprendizaje de RNA-Seq?

La pregunta no está clara para mí. ¿Quiere decir qué tan difícil es aprender cómo secuenciar ARN / ARNm total (extracción de ARN, preparación de la biblioteca, secuenciación y todos los pasos intermedios) o qué tan difícil es aprender a analizar los datos resultantes ( como archivos FASTQ) con métodos bioinformáticos?

  1. Lectura de literatura
  2. Learning shell (awk y sed son extremadamente potentes y pueden ahorrar gran cantidad de tiempo), R y Perl.
  3. Ensuciarse las manos con la escritura de códigos y probar las herramientas para mapeo, ensamblaje y predicción (idealmente, un pequeño cromosoma ex22 puede ayudarlo a comprender)

Inicialmente, todo puede parecer un poco confuso, pero a medida que sigas intentando ejecutar tus herramientas y resolviendo los problemas, podrás entender cómo funciona.
Creo que la parte más importante viene cuando llegas a la etapa en que termina tu parte computacional y comienza la parte de análisis. Comprender lo que dicen los datos y darle sentido es donde su gráfico puede caer, pero así es como suele suceder.
Espero que esto ayude 🙂