Yo diría que el ADN genómico de origen natural, en ausencia de otras proteínas, solo tiene estructuras secundarias: ADN de forma B (la doble hélice “típica”) y ADN de forma Z (que solo se forma en tramos largos de pares de bases de GC alternantes) ) La desoxirribosa del ADN limita severamente las posibles conformaciones que puede adoptar la columna vertebral; como consecuencia, realmente no hay estructuras terciarias de las que hablar.
Si está dispuesto a incluir proteínas adicionales, podría argumentar que el ADN genómico también tiene estructura terciaria y cuaternaria. Los nucleosomas tienen una influencia absoluta en la estructura de los cromosomas individuales, y los genomas in vivo tienen una enorme cantidad de organización espacial que está determinada por la localización subnuclear de los factores reguladores que se asocian con el ADN. Los experimentos de captura de la conformación cromosómica (3C y sus primos de alto rendimiento 5C y Hi-C) demuestran una gran cantidad de interacciones reproducibles a larga distancia entre cromosomas separados; eventualmente, podremos determinar estructuras de “genoma” 3D usando Hi-C.
Si no quieres admitir proteínas adicionales, algunos enfoques sintéticos pueden hacer que las cosas salgan del ADN que casi se asemeja a la estructura cuaternaria. Al diseñar familias de oligonucleótidos en las que cada miembro puede emparejarse con otros miembros simultáneamente, puede construir una amplia variedad de estructuras complicadas similares a celosía. El ejemplo más simple de esto es probablemente el ADN cruciforme, que se puede formar cuando dos secuencias (oligos o más grandes) pueden formar horquillas internas, y luego pares de bases entre sí a través de las secuencias flanqueantes. La aplicación sintética de esta idea tiene el desafortunado nombre de origami de ADN y está empezando a entrar en el ámbito de la ciencia práctica de los materiales.
