Uso de software predictivo in-silico o evaluaciones QSAR (relación de actividad de estructura cuantitativa). Toxtree es un software predictivo basado en reglas que puede identificar alertas estructurales de carcinogenicidad genotóxica (restos reactivos de ADN con actividad electrófila) o carcinogenicidad no genotóxica (carcinogenicidad a través de mecanismos epigenéticos o indirectos, no tan bien caracterizados). VEGA es un software predictivo basado en estadísticas que compara un químico con grupos de sustancias químicas estructuralmente relacionadas con actividad experimental conocida, para determinar qué tan probable es que el químico no caracterizado sea mutagénico (genotóxico) o carcinogénico (genotóxico o no genotóxico). Normalmente utilizo códigos SMILES (códigos simplificados de entrada de línea de entrada molecular) para crear las estructuras químicas dentro del programa. Estos códigos están disponibles a través de pubchem (por ejemplo) y se puede acceder buscando el nombre químico o CAS #. El software QSAR también puede predecir puntos finales tóxicos adicionales, como el potencial de toxicidad sistémica (Toxtree; Cramer clasificación I, II o III, siendo I la clase menos tóxica) o toxicidad en el desarrollo o la reproducción (VEGA; aunque muchos de estas predicciones no han sido confiables en mi experiencia, debido a la escasez de datos disponibles sobre estos puntos finales). Son descargas gratuitas y divertidas para jugar. Échales un vistazo.
¿Cómo puede alguien predecir computacionalmente si una sustancia es cancerígena?
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Hay muchos métodos, como muchas clases de carcinógenos.
Para los carcinógenos químicos , existe el método de Ame ( prueba in vitro) en el que la mutación en una cepa particular de la bacteria tifoidea es un indicador positivo de la capacidad carcinogénica de un carcinógeno . Y el otro está inoculando el carcinógeno sospechado a través de varias rutas en animales de experimentación ( prueba in vivo)
En caso de radiación y carcinógenos microbianos , su principalmente mediante la extrapolación de las estadísticas epidemiológicas en un área geográfica con las estadísticas de ese cáncer en particular bajo las mismas restricciones geográficas. Más bien, los marcadores moleculares en forma de mutaciones en genes críticos a veces son patológicos para cánceres particulares.
Sin embargo, en la mayoría de los casos, los métodos anteriores están relacionados con un carcinógeno particular con su cáncer concomitante en lugar de con predicciones de potenciales carcinogénicos previsibles.
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