Estás parcialmente correcto. Las proteínas tienen grupos nucleofílicos (base de Lewis) y electrofílicos (ácido de Lewis), así como grupos de bases de Bronsted y Bronsted, todos los cuales pueden ayudar a catalizar una reacción. Los polisacáridos tienen grupos nucleofílicos, pero no demasiados grupos de ácidos Bronsted o Lewis. Por ejemplo, no hay muchos metalo-sacáridos, mientras que muchas enzimas son metaloproteínas, es decir, que contienen uno o más átomos metálicos, así como los elementos habituales {C, H, N, O, P, S}.
También es importante que los diversos sitios Lewis / Bronsted ácido / base estén en la configuración correcta (distancia y ángulos entre los sitios) para promover la reacción. Las proteínas son lo suficientemente rígidas como para mantener los sitios reactivos en esta configuración para la reacción, pero lo suficientemente flexibles como para permitir que los reactivos y productos entren y salgan.