Cómo acoplar proteínas asimétricas en el acoplamiento multimolecular

Hola… Me faltan las habilidades de acoplamiento en este momento, pero puedo sugerirle que pruebe el software de python y su protocolo para comprender los conceptos básicos del acoplamiento. Por favor, sigue el enlace. Contiene algunos pasos básicos…
¿Cuál es la probabilidad de que dos secuencias de 100 aminoácidos compartan el 80% de su secuencia por azar?

Hay 4 aminoácidos en una secuencia de ADN, ACTG, 4 elementos diferentes en cada punto. Piense en esto como un mazo de 100 cartas con 4 palos (ACTG), y usted está preguntando cuáles son las probabilidades. 2 mazos…
¿Qué harías para comprender el mecanismo molecular de la proteína X cuando no tienes ninguna similitud primaria basada en secuencias con proteínas conocidas?

El mecanismo molecular es un término muy amplio que a todos nos gusta usar cuando no estamos seguros de lo que hace una proteína, así que asumiré que la pregunta es sobre la función. Aquí hay algunas cosas…
Quiero ayudar a avanzar en nuestra comprensión del plegamiento de proteínas. ¿Debo enfocarme en mejorar las simulaciones, leer datos o algo completamente diferente?

Depende de la parte a la que desee contribuir. Puede elegir mejorar mejor las simulaciones y las predicciones de estructura de secuencia, o puede hacer experimentos para comprender el proceso de plegado en un sistema determinado.
¿Por qué es importante la predicción de la función de la proteína?

Muchas gracias por A2A, Siendo del campo de los académicos, si me preguntan cuál es la función de la proteína y por qué la predicción de su función es importante, encontraré más de 100 de literatura que dirá…
¿Qué es un modo propio en el lenguaje común (puntos de bonificación si puede relacionarlo con el enfoque de análisis estadístico de acoplamiento para proteínas)?

Probablemente no soy la mejor persona en Quora para responder a esto, pero lo intentaré. Esta no es una pregunta fácil de responder en “lenguaje común”. Básicamente, estas cosas son matemáticas y es difícil entender la interpretación (y…
¿Por qué se supone que las proteínas que tienen secuencias similares tienen estructuras muy similares?

Hola, Una adición adicional a todas las respuestas, especialmente la de Chad, es dejar de pensar en ellas como entidades biológicas por un minuto. Piense en ellos como grandes moléculas químicas. Toda la materia está hecha de diferentes…
Cómo usar una alineación de secuencia de proteínas para identificar residuos de aminoácidos que pueden probarse para funciones funcionales importantes

Lo primero que debe hacer es buscar residuos conservados en la secuencia de alineación. La conservación de la secuencia es necesaria, pero no es suficiente para decir si un residuo tiene un papel funcional importante. Es necesario porque…
Cuando se aplica una agrupación jerárquica al ARN de las células dif del mismo tipo de célula, ¿cuánta consistencia existe en los genes agrupados por el mismo grupo?

Tuve la oportunidad de trabajar con células de Dna de levadura y predecir sus resultados cuando se sometieron a varios antígenos. Antes de desarrollar los modelos de predicción, utilicé el agrupamiento jerárquico supervisado aglomerativo y divisivo, y comparé…
¿Cuál es la simulación informática más detallada de la abiogénesis?

http://www.damer.com/pubs.newsit… Esta parece ser la propuesta más completa para una simulación detallada del origen de la vida. Por lo que puedo determinar, fracasó cuando el autor consiguió mensajes después de su doctorado. Nada encontrado más tarde fue tan…