Biología estructural: ¿cuánto “bioquímicos no computacionales” confían en la dinámica molecular?

En general, la mayoría de los biólogos experimentales lo usarán para respaldar una hipótesis si concuerda con algunos datos o ideas que tienen, pero lo ignorarán libremente si no lo hace. El problema no es siempre la educación…
¿Cómo se determina el plegamiento de proteínas?

Está determinado por múltiples factores: la secuencia de aminoácidos dentro de la estructura primaria de la proteína de la cadena polipeptídica – el plegamiento de la proteína se produce debido a las interacciones entre los residuos de aminoácidos.…
¿Cómo se modelan computacionalmente las interacciones proteína-lípido?

Las interacciones proteína-lípido se estabilizan mediante la formación de enlaces de hidrógeno intermoleculares, interacciones de van der Waals, interacciones hidrofóbicas y puentes iónicos (especialmente residuos de aspartato o glutamato) entre la proteína y el ligando lipídico. Los sitios…
¿BioBricks no logró su propósito de biología de ingeniería?

La respuesta corta es: No. Los Biobricks no se han convertido en el estándar omnipresente para la biología sintética, pero definitivamente no han fallado. Teniendo en cuenta que comenzó hace más de 10 años, definitivamente ha inspirado muchos…
¿Puede una Superinteligencia Artificial encontrar curas para enfermedades incurables?

Respuesta corta: SÍ. Sin embargo, es más complicado que eso. La curva de aprendizaje en el caso de la IA es exponencial, por lo que en los próximos años, la probabilidad de que ASI encuentre una cura aumentará…
¿En qué se relacionan las coordenadas X, Y, Z en un archivo de base de datos de proteínas (PDB)?

La coordenada XYZ 0,0,0 se encuentra en la esquina de una unidad asimétrica de la red cristalina. Aunque, también es algo arbitrario, y puede ser movido por el usuario.
¿Qué nos dice una estructura sobre la función de la proteína?

En la bioquímica de proteínas, la estructura cuaternaria se refiere a la capacidad de múltiples unidades independientes más pequeñas para unirse en una estructura proteica más grande. [1] Muchas proteínas de membrana cruzada vienen en unidades múltiples, pero…
¿De dónde aprendieron tanto Akshari Gupta, Robin Corey y Sai Janani Ganesan acerca de la biología estructural? Ver comentarios para detalles adicionales.

No puedo hablar por Akshari o Sai (quienes estoy de acuerdo parecen saber cantidades increíbles sobre una amplia gama de disciplinas científicas), pero he descubierto que la mejor manera de dominar una disciplina científica en particular es trabajar…
¿Qué se sabe sobre los límites de la complejidad biológica como consecuencia de la evolución?

La evolución no limita inherentemente la complejidad. De hecho, la complejidad no es un factor en absoluto; las únicas cosas en juego en un proceso evolutivo son heredabilidad , mutación y aptitud (es decir, éxito reproductivo diferencial basado…
¿Se usan variedades para modelar estructuras proteicas?

Sí. No soy del todo leído sobre el tema, así que no señalaré ninguna referencia específica, pero la idea es muy natural. Un modelo simplista de una proteína sería considerarlo como un gráfico etiquetado incrustado en [math] \…