¿Cuáles son algunos motivos estructurales que son imposibles de crear con los 21 aminoácidos estándar?

La pregunta que se hace es difícil, si no imposible, de responder. Los “motivos estructurales” se definen como motivos porque son estructuras regulares observadas en los péptidos, por lo tanto, están claramente y obviamente construidos con los aminoácidos…
¿Qué tan importante es el plegamiento de proteínas para la investigación del envejecimiento?

En general, el plegamiento de proteínas ayuda a las personas a comprender una función de proteína a partir de su información de secuencia. Esperamos poder encontrar la diferencia sustancial en la estructura de la proteína relacionada con la…
¿Hay algún problema bioquímico abierto que pueda resolverse con métodos computacionales independientes de los métodos biológicos?

Creo que un buen problema bioquímico es la estructura libre mínima de la fibra de cromatina de 30 nm (si tal cosa existe). Actualmente hay varios modelos propuestos para la fibra de 30 nm También hay varias soluciones…
¿Es posible predecir computacionalmente las interacciones proteína-proteína a escala genómica amplia?

Hay dos formas de hacer predicciones: (1) Usar simulaciones atomísticas para simular las interacciones proteína-proteína. En teoría, esto puede proporcionar una gran precisión, pero es muy lento y depende de campos de fuerza precisos para aproximar los efectos…
¿Qué significa que la mayoría de los “campos de fuerza de proteínas están fuertemente parametrizados en las estructuras de AP”?

Un campo de fuerza es una función matemática destinada a calcular la energía potencial de una molécula dada su geometría. Los campos de fuerza usuales se basan en una formulación mecánica clásica que típicamente modela interacciones ligadas (todo…
Cómo encontrar el conjunto completo de proteínas para el que una molécula tiene afinidad de unión (ketamina, por ejemplo)

Esta es una situación bastante común en bioquímica. Está investigando un químico y desea encontrar toda la información que pueda sobre él. Desafortunadamente, Pubmed no está configurado para esta tarea. Mientras que la ketamina específicamente es lo suficientemente…
¿Cuáles son los materiales de estudio necesarios si deseo relacionar la topología con la ciencia de las proteínas?

Bueno para la topología de proteínas, consulte estos materiales. Puede descargarlos desde http://bookzz.org o descargarlos a través de torrent. Protein Folding in the cell – Academic Press, Vol 59, Editado por Arthur L. Horwich Mecanismos de plegamiento de…
¿Cuándo y si llegamos a decodificar la función de cada gen en el ADN humano, podremos ajustar computacionalmente nuestro ADN?

No, por la misma razón que no podrás construir un cohete de propulsión nuclear solo porque conoces todas las letras en inglés. Las letras están todas allí, pero todavía tiene que pasar por el proceso de aprender a…
¿Dónde puedo encontrar un buen lugar para trabajar después de obtener un doctorado en bioquímica (investigación del cáncer / bioinformática) si estoy interesado en incorporar el aprendizaje automático en mi trabajo?

EMBL Heidelberg. Por lo que yo sé, han hecho y todavía hacen una gran cantidad de microscopía muy sofisticada para la cual el análisis a menudo requiere algo de aprendizaje automático.
¿Cuáles son algunos artículos fundamentales sobre el plegamiento de proteínas?

El tema ha evolucionado constantemente en las últimas décadas. Algunos de los clásicos son por: – Anfinson – Tanford – Schmid – Eneldo – Creighton Las siguientes reseñas son sobresalientes por lo que escuché. Todavía los estoy buscando:…