¿Qué factores determinan el área superficial accesible al disolvente (SASA) de una proteína?

En general, la elección del disolvente en sí es el único factor abrumador. Las dos principales fuerzas que impiden que una proteína sea una proteína son su afinidad por sí misma (que conduce a ensamblajes herméticos como hojas…
¿Cómo son las estructuras de rayos X de varias proteínas?

Todos están archivados en línea en www.pdb.org.
Al hacer mutantes fosfomiméticos para residuos de serina / treonina, qué sustitución es mejor: Asp (D) o Glu (E)?

Creo que ambos están bien, probablemente también depende de diferentes proteínas. Probablemente sea mejor probar ambos si el resultado realmente importa.
¿Qué hizo Dorothy Hodgkin?

Dorothy Hodgkin fue la primera en descubrir la estructura de la penicilina, que es la estructura química del logotipo. Su otro gran logro fue determinar la estructura de la insulina.
¿Alguien ha estudiado las propiedades de plegamiento de cadenas de aminoácidos generadas al azar? Si es así, ¿cuáles fueron los resultados y cómo difirieron de los de las proteínas encontradas en la naturaleza?

Sí, muchos investigadores que estudian el plegamiento de proteínas y la agregación estudian secuencias peptídicas. En lugar de generar cadenas aleatorias, se ha trabajado mucho para identificar patrones y explorar el papel de las propiedades fundamentales de una…
¿Cuál es el progreso en el Proyecto Proteoma Humano?

Lo mejor es mirar papeles y conjuntos de datos: 1. papers: Journal of Proteome Research, número de enero de 2014: Volumen 13, Número 1 (Publicaciones de ACS) informe sobre el progreso realizado en el segundo año de la…
¿Cuál es la diferencia entre la estructura desordenada de una proteína y la estructura de bucle?

Buena pregunta. Para ser muy general, una estructura de bucle normalmente se refiere a un tramo de proteína que conecta dos estructuras secundarias consecutivas, generalmente hélices u hojas. Algunas propiedades generales de los bucles son: No son muy…
¿Cómo la estructura secundaria en un ácido nucleico afecta la profundidad de cobertura en su secuenciación profunda?

Si una secuencia tiene tendencia a formar bucles en horquilla (por ejemplo, GGGGGCCCCC …) u otras estructuras que interfieren con la unión de las secuencias diana, pueden estar subrepresentadas.
¿Qué sondas moleculares se usan para medir los bolsillos hidrofóbicos?

Dos formas de interpretar esta pregunta: ¿Qué sonda molecular puedo usar para determinar experimentalmente la presencia de un bolsillo hidrofóbico en una proteína? Los espectros de las sondas fluorescentes ANS y Bis-ANS dependen del entorno. Fluorescencia mucho más…
¿Cómo forma la caspasa 1 los poros en la membrana celular?

La pregunta de cómo la caspasa-1 inicia la piroptosis es interesante. Sin embargo, mi escaneo rápido de la literatura no trae revisiones generales recientes del tema. Encuentro una cantidad de trabajos de investigación individuales que estudian el problema…