Suponiendo que sería un costo prohibitivo, y que los virus fuente fueran puros y no tuvieran estabilizadores químicos, ¿sería más seguro y posible inhalar la vacuna de la fuente pura en una dosis regulada?

Depende completamente del virus. La mejor vacuna generalmente se administra en el sitio de entrada a su cuerpo, como la vacuna contra la gripe intranasal, versus la vacuna contra la gripe intramuscular que es la inyección habitual. Otro ejemplo es la vacuna contra la polio, en la que puede tomar la vacunación oral que previene cualquier infección o la vacunación IM que previene la infección de su sistema nervioso pero no evita que el virus establezca una infección inicial.
Inhalado no es la palabra correcta, porque eso solo funcionaría para las enfermedades que realmente infectan sus pulmones. La mayoría de las infecciones del tracto respiratorio en realidad comienzan en el epitelio nasal, por lo que al principio de la enfermedad de la gripe puede sentir esa molestia en la parte posterior de la garganta. Solo más tarde llega a tus pulmones.
Tendría que leer algunos documentos y no tengo acceso a ellos en este momento, pero tengo la sensación de que las vacunas de Mucosal requieren virus vivos, por lo que no siempre utilizamos la inoculación de la mucosa. Para la mayoría de la gente, la inmunidad general recibida de las vacunas IM es suficiente, ya que un par de rondas de replicación en su epitelio no son realmente una amenaza para su salud.