Las proteínas “insolubles” son proteínas que son insolubles en agua pero que pueden ser solubles en medio lipídico / aceitoso o con detergentes. En general, estas proteínas insolubles se encuentran en la membrana celular o están estrechamente asociadas a la membrana. También pueden formarse debido al mal plegamiento de (generalmente) proteínas solubles.
La insolubilidad de estas proteínas se puede explicar en función de su estructura cuaternaria. Cuando se someten a plegamiento, los aminoácidos hidrofóbicos como fenilalanina, triptófano, cisteína, valina, etc. están expuestos (se mueven a la superficie externa de la proteína), lo que los hace insolubles en el medio acuoso. Por lo tanto, cuando ciertas proteínas solubles en agua se pliegan incorrectamente y si se exponen varios aminoácidos hidrófobos, también pueden volverse insolubles. Estas proteínas luego forman agregados / cuerpos de inclusión y pueden precipitar. (como en el caso de las placas amiloides)
El método más común para solubilizar proteínas insolubles (especialmente para estudios estructurales) es el uso de detergentes. Estos detergentes contienen una cola hidrofóbica (que forma un enlace hidrofóbico con la proteína) y un grupo de cabeza hidrófilo (que forma enlaces de hidrógeno con las moléculas de agua), por lo tanto, solubilizan la proteína. En concentraciones más altas, forman micelas de detergente que actúan como membranas lipídicas artificiales y, por lo tanto, pueden solubilizar proteínas de membrana. Ejemplos comunes son Brij, CHAPS, Dodecyl-maltósido, etc.
Otros métodos incluyen el uso de liposomas, microsomas, nanodics / PNL, etc.
Obviamente, si no necesita proteína funcional, puede simplemente solubilizar los agregados en SDS u otros detergentes desnaturalizantes, urea, glicerol, etc.