La respuesta que probablemente no quería escuchar es: depende.
El mayor costo es la tecnología utilizada para evaluar los SNP. En el caso de 23andMe, usan un microchip de Illumina. Además del costo del chip, debe tener en cuenta el capital requerido para procesar y escanear estos chips, de nuevo, en este caso, un iScan o HiScan. También me imagino que si están procesando a gran escala necesitarían algún otro equipo para un procesamiento de alto rendimiento.
Existen otras tecnologías disponibles para analizar los SNP, con sus positivos y negativos (por ejemplo, los métodos de PCR en tiempo real).
A continuación, tiene los costos de los kits de escupido, envío, personal de laboratorio, científicos para el análisis, etc., etc. incluso antes de llegar a la informática descendente.