Bien, dado que se fabrican en la celda, una ventaja es que no es necesario transportarla al exterior, lo que requiere energía y tiempo y el uso de maquinaria. Una desventaja es que los procesos dañinos (como la proteólisis) probablemente se realicen mejor en un ambiente protegido (por ejemplo, lisosoma de doble membrana, que cuenta como afuera) o afuera. Entonces, por ejemplo, si usted cuenta los lisosomas dentro de la célula, otra ventaja obvia es que otros no pueden robar sus alimentos (/ productos de su trabajo a través de enzimas) tan fácilmente.
Finalmente las enzimas intracelulares se pueden regular y reciclar más fácilmente, por ejemplo a través de la ubiquitinación y el proteosoma. Creo que esas serían las principales razones por las que se me ocurre, aunque supongo que normalmente la función de la enzima determinará su localización, simplemente va donde se necesita hacer el trabajo (los procesos intracelulares usan enzimas intracelulares, los procesos extracelulares requieren enzimas extracelulares, a menudo no existe la opción de hacer lo mismo en otro lugar: las enzimas extracelulares pueden debido a la localización no operar directamente en la maquinaria intracelular)
editar: bueno, supongo que olvidé enumerar la ventaja más obvia: disponibilidad de recursos (como atp) para impulsar las reacciones catalíticas … 😛