Ambos son producidos por ribosomas unidos al retículo endoplasmático rugoso, pero las proteínas de membrana integrales tienen segmentos específicos en sus secuencias que son particularmente hidrófobos que les permite incrustarse en una membrana lipídica a medida que se van traduciendo. Dependiendo de cuántos de estos segmentos tengan, eso determinará cuántas veces la proteína atraviesa la membrana. Luego viajan en vesículas a través de la ER suave y Golgi a la membrana plasmática donde las vesículas se fusionan con la membrana plasmática. La orientación de las proteínas integrales se retiene, cualesquiera que sean las partes que se encuentren frente al citoplasma continúan haciéndolo, y la parte que mira hacia el lumen del RE se enfrenta a la fase extracelular.
Las proteínas secretoras, por otro lado, no contienen dicho segmento transmembrana en su secuencia por lo que se producen en la luz del RE, luego se empaquetan, viajan a través del RE suave y el Golgi nuevamente si se necesita alguna modificación necesaria, y se liberan como vesículas estalló. Estos diagramas pueden ayudar a visualizar lo que dije
