Como dijo Priyabrata, la tinción de Coomassie es una de las formas más comunes de visualizar SDS-PAGE. Este es un buen método cuando tiene una gran cantidad razonable de proteína en el gel. Pero si tiene cantidades muy bajas, existen otros métodos que pueden permitirle ver su proteína.
- Tinción de plata: Me encanta este método porque es muy sensible, al rango bajo de nanogramos, y no requiere ninguna solución particularmente especial. Las proteínas se unen a los iones de plata y esos iones pueden reducirse, lo que les permite ser visibles a simple vista. (Tinción de plata de proteínas en geles de poliacrilamida)
- Zinc Staining: Este es un método interesante porque en realidad no mancha la proteína en el gel, pero se compleja con imidazol en las regiones del gel que no tienen proteína saturada con SDS. Esto hace que el fondo sea opaco y las bandas de proteínas sean claras. Puedes visualizar esto sobre un fondo oscuro. (http://camelot.bioc.cam.ac.uk/~m…)
- Tinción con colorante fluorescente: estos métodos de tinción son bastante caros, pero probablemente sean los más sensibles de todos los métodos. He usado SYPRO Ruby antes y funciona increíblemente bien. Este método es excelente si va a extraer bandas de los geles para realizar más análisis de espectrometría de masas. Esto no altera ningún grupo funcional en la proteína y se une a un método de tinción más convencional como Coomassie. (Manchas de gel de proteína fluorescente)
- Manchas específicas de grupos funcionales: si busca proteínas en sus geles que tengan modificaciones específicas como fosforilación, glicosilación, etc. Hay manchas disponibles que mancharán solo esas bandas.
Aquí hay un excelente enlace de Thermo sobre estos diferentes métodos.
Métodos de tinción con gel de proteína
