El caso mejor documentado de endogamia extrema fue la Casa Real de Habsburgo en España.
Este es Carlos II de España, el último Habsburgo español en una familia que rutinariamente se casaba con primos y otros parientes para proteger su riqueza. Sus propios padres eran tío / sobrina y su antepasado, Joanna of Castile, aparece en su árbol genealógico no menos de catorce veces debido a la unión de primos y primos segundos. Se dice que la composición genética de Charles II estaba más confusa de lo que hubiera sido si sus padres hubieran sido simplemente hermano y hermana.
Como resultado de la endogamia, un rasgo familiar, llamado prognatismo mandibular (o mandíbula baja) se volvió más y más extremo hasta que Carlos II fue tan pronunciado que se dijo que en realidad no podía masticar su comida y que el tamaño de su lengua lo hizo babear significativamente. Se ve claramente en el retrato de arriba, recordando que los fabricantes de retratos reales tenían que ser muy halagadores.
Carlos II también tenía problemas mentales y se consideraba levemente retrasado. No aprendió a hablar hasta que tenía cuatro años y no podía caminar hasta la edad de ocho años. Como adulto, su discurso fue tan pobre que, en su mayor parte, no pudo ser comprendido. También era infértil y su árbol genealógico terminó cuando murió.
Debido a que los pedigríes reales están tan bien documentados, el caso de los Habsburgo ha sido extensamente estudiado en investigaciones sobre los efectos de la endogamia.
