Primero, unir una proteína a un par de electrodos, incluso con corriente cero, podría afectar su conformación. Luego, al pasar una minúscula corriente a través de él, sospecho que podría causar una mayor desnaturalización, aunque solo sea por la resistencia eléctrica que calienta la molécula. Más actual, y probablemente solo freirías la molécula como un fusible sobrecargado que se derrite.
¿Por qué no lo intentas e informas tus hallazgos en Nature o Science ?