Es importante destacar que la mayoría de las proteínas y enzimas logran su conformación 3D final en el retículo endoplásmico con la ayuda de una serie de chaperones moleculares. Estas chaperonas se unirán a las regiones hidrofóbicas expuestas de la proteína hasta que se logre la conformación 3D correcta. Una vez que esto ocurre, la proteína se exporta desde el retículo endoplásmico y se envía a su ubicación adecuada en la célula (o fuera de la célula).
Otros factores que influyen en la forma de la proteína, incluidos los radicales libres, que pueden dar como resultado la oxidación de una proteína, conducen a una conformación tridimensional alterada y mal plegada, en cuyo caso la proteína probablemente sea el blanco de la degradación.
Los priones, que son proteínas infecciosas y mal plegadas, como las que causan la encefalopatía espongiforme bovina, también pueden hacer que las proteínas se plieguen espontáneamente en los priones.
En última instancia, hay muchos factores celulares (endógenos) que funcionan para asegurar que se produzca un plegamiento de proteínas adecuado, pero el estrés ambiental puede aumentar la tasa de plegamiento incorrecto de las proteínas con el tiempo y esto conduce a una serie de enfermedades, incluidas muchas enfermedades neurodegenerativas.
