¿Cuáles son los números de aminoácidos que participan para formar un enlace H dentro de la estructura secundaria de una proteína?

No tengo idea de lo que quieres decir con “números de aminoácidos”. Los enlaces de hidrógeno de estructura secundaria se forman entre los hidrógenos de amida de un enlace peptídico y el = O de otro. En la hélice alfa, es el cuarto enlace peptídico hacia abajo (o hacia arriba) de la cadena, si eso es lo que preguntas. Se pueden formar otras hélices con mayor o menor distancia, y en hojas beta la distancia puede ser arbitrariamente grande.