¿Qué sucederá si una muestra de proteína / péptido se digiere en una enzima por más tiempo que el protocolo?

En la práctica, depende de cuánto tiempo lo dejes. Teóricamente, nada debería suceder una vez que un sustrato enzimático y sus productos finales alcanzan un equilibrio. Sin embargo, cualquier actividad enzimática contaminante o no específica que de alguna manera haya ingresado en la muestra (y que a menudo habrá) continuará. Por lo general, un tiempo de reacción es tal que la enzima añadida a la reacción procesa el sustrato mucho más rápido que cualquier actividad contaminante, simple debido a un exceso considerable de la enzima añadida y su actividad. Entonces, aunque la teoría sugiere que debe alcanzarse un equilibrio y que no debe pasar nada más, siempre existe la posibilidad de una actividad enzimática no deseada que podría degradar su muestra. Por lo tanto, la mejor práctica (o experiencia) da un límite de tiempo para una reacción en las condiciones recomendadas. Esencialmente, es por eso que no debe dejar que una reacción vaya mucho más allá de los tiempos sugeridos.