¿Cuál es la diferencia entre un motivo y un dominio en una proteína?

Gracias por A2A,

pero creo que Ameya Dravid contestó correctamente tu pregunta.

Entonces, básicamente, un motivo de proteína es una estructura supersecundaria que consiste en una hélice alfa y / o una lámina beta y una espiral aleatoria. Puede no tener necesariamente funciones biológicas.

Sin embargo, los dominios de proteínas están estructurados en 3 dimensiones sobre / en una proteína que puede interactuar con otras proteínas / macromoléculas / moléculas y que tienen algunas funciones biológicas. Por ejemplo, los factores de transcripción (TF) son un grupo de proteínas que tienen ‘dominios de unión al ADN’. Los TF se sientan en el segmento promotor o potenciador del ADN utilizando su dominio de unión a ADN antes / durante la síntesis de ARN a partir del ADN. Algunos TF tienen dominio que se unen en el Surco Mayor de ADN, algunos se unen al Surco Menor.

Editar 1:

Los motivos no son independientemente estables (no son estables de la proteína). Los motivos pueden ser parte de los dominios.

Los dominios son estables independientemente.

Editar 2:

Si un motivo puede tener una función biológica, se lo puede llamar dominio. Por ejemplo: los motivos de dedo de cinc están relacionados con la unión al ADN, por lo que también se los denomina dominios de dedos de cinc.

Entonces, todos estos medios, los Motivos son características estructurales y los Dominios son regiones funcionales de una proteína.

Motif se define como la estructura súper secundaria en una proteína. Pueden ser tan pequeños como tripéptido, una secuencia de aminoácidos simples que están implicados principalmente en algún papel funcional para la proteína. Los ejemplos incluyen el motivo de la clave griega, el motivo de dedo de zinc, el lazo de Omega, etc. Los motivos son en su mayoría parte del dominio, pero viceversa no es posible.

Los dominios son entidades estructuralmente grandes e implican la estructura cuaternaria de la proteína. Estos son restos de proteína plegados independientemente que se pueden diferenciar estructural y funcionalmente. En general, se considera que son las unidades repetitivas en proteínas grandes. Los ejemplos incluyen beta barril, dominio PDZ, pliegue de globina que se encuentra principalmente en inmunoglobulinas, repeticiones de cadherina encontradas en proteínas de adhesión dependientes de calcio.

Por motivo, supongo que te refieres a un motivo estructural. Si es así, la siguiente explicación podría ser presentada:

Los dominios son un grupo de residuos que se encuentran en una vecindad estructural entre sí, pero a menudo distintos de otros residuos de la proteína, que podrían formar otro dominio. Normalmente, los dominios se pueden identificar mediante matrices de distancia.

Los motivos estructurales por otro lado son una combinación de elementos estructurales secundarios, o un grupo de residuos, que están involucrados en conferir alguna función a esa región de la proteína. Por ejemplo, el motivo hélice-giro-hélice podría estar presente para la unión al ADN. El motivo EF-hand podría estar presente en la región de unión a calcio de la proteína. Tales motivos típicamente no forman un dominio independiente en una estructura de proteína.

Un DOMINIO de proteína es un polipéptido conservado que forma parte de una proteína, que puede plegarse y funcionar de forma independiente.

En palabras simples, el dominio es una proteína estructurada terciaria .

Generalmente, una proteína se compone de una mezcla de dichos dominios polipeptídicos.

Por ejemplo, el dominio de unión a NAD está presente en Lactato deshidrogenasa y en Alcohol deshidrogenasa.

Mientras que, por otro lado, MOTIF es una proteína estructurada supersecondary formada a partir de secuencia consecutiva de estructuras primarias.

Por ejemplo, los dominios de unión a NAD tienen un motivo beta-alfa-beta-alfa-beta .

Pero no pueden unirse a NAD por su cuenta, sino que necesitan formar dominios complejos para enlazar NAD.

Espero que esto ayude. 🙂

Los dominios de proteína son una entidad estructural, que generalmente significa una parte de la estructura de la proteína que se pliega y funciona de forma independiente. Entonces, las proteínas a menudo se construyen a partir de diferentes combinaciones de estos dominios.

Motivo se refiere a un conjunto de elementos de estructura secundarios contiguos que o bien tienen un significado funcional particular o definen una porción de un dominio plegado independientemente. Después de que la cadena peptídica de una proteína se ha organizado en tramos sucesivos de elementos secundarios, las combinaciones de tales elementos se organizan primero en grupos distintivos llamados motivos súper secundarios. Varios elementos secundarios vecinos y motivos supersecondary se pliegan y se tuercen más en el cúmulo globular compacto llamado un dominio.

Para las proteínas , los motivos de secuencia pueden caracterizar qué proteínas (secuencias de proteínas ) pertenecen a una familia de proteínas determinada. … También hay modelos de motivos más complejos. Los dominios proteicos , por otro lado, son una entidad estructural, que generalmente significa una parte de la estructura de la proteína que se pliega y funciona de forma independiente.

Motif es una parte del dominio. El dominio es la parte funcional en una proteína.