¿Cuáles son los inconvenientes de usar la difracción para caracterizar la estructura de la proteína?

Un problema que veo es que necesita la proteína para cristalizar primero, y obtener una proteína para formar un cristal que sea lo suficientemente grande y puro para el análisis no es trivial. E incluso entonces, no tienes garantía de que la estructura que ves sea exactamente la misma que en vivo .

Además, es extremadamente difícil crear imágenes de bucles flexibles que no tienen una conformación fija. Esto puede ser bastante frustrante si se sabe que este ciclo está involucrado en la unión del ligando o catálisis, pero no se puede resolver su conformación (es) de “trabajo” porque en cada molécula en el cristal esta región tiene una conformación ligeramente diferente.

El mayor problema (en realidad, al obtener difracción) es que las estructuras son estáticas y proporcionan muy poca información dinámica. Una foto puede ser de mil palabras pero un video te dice mucho más. Identificar las conformaciones alternativas interesantes es el mayor desafío que la cristalografía de rayos X no puede resolver fácilmente.